一大第六次會議剛開始，就遭受法租界巡捕房的侵擾。首先闖入會場的叫程子卿，他是黃金榮的把兄弟，利用這層關系進入巡捕房，任華人探長。原來馬林由莫斯科途經歐洲來華，曾在維也納被警察局拘捕，雖經營救獲釋，但其行動一直作為“赤色分子”被嚴密監視。具有豐富秘密工作經驗的馬林，警覺地說這人一定是“包打聽”，建議立即停會，大家分頭離開。
果然，十幾分鐘后兩輛警車包圍了一大會址，法籍警官親自帶人進入室內詢問搜查，沒有找到多少證據，威脅警告一番后撤走了。這次沖擊雖然沒有帶來重大損失，畢竟一大不能再在原址進行了。轉移出來的一大代表當晚集中于李達寓所商討，大家一致認為會議不能在上海舉行了，有人提議到杭州開會，又有的提出杭州過于繁華，容易暴露目標。當時在場的李達夫人王會悟提出：不如到我的家鄉嘉興南湖開會，離上海很近，又易于隱蔽。大家都贊成，覺得這個安排很妥當。
第二天清晨，代表們分兩批乘火車前往嘉興。兩位國際代表目標太大，李漢俊、陳公博也因經歷一場虛驚，都未去嘉興。１０時左右，代表們先后到達嘉興車站，在鴛湖旅館稍事休息后，登上事先租好的南湖畫舫。
這是一個陰天，下起了蒙蒙細雨，游人漸漸離去，秀麗的南湖顯得格外清靜優雅。１１時許，一大會議在緩緩劃行的畫舫上開始了。
南湖會議繼續著上海３０日未能進行的議題，先討論并通過《中國共產黨的第一個綱領》，這份１５條約７００字的簡短綱領，確定了黨的名稱、奮斗目標、基本政策、提出了發展黨員、建立地方和中央機構等組織制度，兼有黨綱和黨章的內容，是黨的第一個正式文獻。
接著討論并通過《中國共產黨的第一個決議》，對今后黨的工作作出安排部署，鑒于黨的力量還弱小，決定以主要精力建立工會組織，指導工人運動和做好宣傳工作，并要求與其他政黨關系上保持獨立政策，強調與第三國際建立緊密關系。
下午５時，天氣轉晴，湖面上一艘汽艇向畫舫急馳而來。大家因有上海的經歷而提高了警惕，立即藏起文件，桌上擺出麻將牌，裝扮成游客。后來打聽到這是當地士紳的私人游艇，大家才松了一口氣，會議仍繼續進行。
最后，一大選舉中央領導機構，代表們認為目前黨員人數少、地方組織尚不健全，暫不成立中央委員會，先建立三人組成的中央局，并選舉陳獨秀任書記，張國燾為組織主任，李達為宣傳主任。黨的第一個中央機關由此產生。會議在齊呼“第三國際萬歲”、“中國共產黨萬歲”聲中閉幕。
一大召開標志著中國共產黨的正式成立，猶如一輪紅日在東方冉冉升起，照亮了中國革命的前程。這是近代中國社會進步和革命發展的客觀要求，是開天辟地的大事變。自從有了中國共產黨，中國革命的面目就煥然一新了。